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Exploration automatique de scènes moléculaires complexes

LARROQUE VINCENT
Abstract: 

L’étude de systèmes moléculaires s’appuie de plus en plus sur la visualisation informatique des molécules mises en jeu dans le but de faciliter l’analyse et la compréhension de leurs mécanismes d’actions. Parallèlement, la recherche en informatique graphique et en rendu a connu un essor considérable ces dernières années. Dans ce projet, nous nous appuierons sur les connaissances issues de la recherche en synthèse d’images pour de développer de nouveaux algorithmes spécifiquement dédies à la visualisation de systèmes moléculaires complexes. L'une des difficultés rencontrées par les biochimistes est l'identification visuelle de structures particulières dans le cas de systèmes complexes : cela nécessite une exploration minutieuse et chronophage de la scène en temps réel tout en ne garantissant pas l'identification d'une structure existante mais visuellement "masquée". Nous proposons dans cette étude le développement d’outils de prise de connaissance automatique des structures moléculaires, en particulier par le calcul automatique de "bons points de vue" (placement automatique de la camera virtuelle). Dans un second temps, des "chemins de caméra" adaptés à ces points de vue seront calculés pour permettre une identification intuitive et rapide de la localisation des structures recherchées dans la molécule. Dans un premier temps, le stagiaire devra effectuer une étude complète de l'état de l'art, en s'appuyant en particulier sur les techniques existantes dans le monde de la mise en scène au cinéma comme dans les jeux vidéos. Ensuite, des rencontres avec les biochimistes pour déterminer les meilleurs structures cibles à détectée seront menées. Dans un second temps, un prototype de détection de structures sera développé sous la forme d'un processus de prétraitement, utilisable pour le rendu interactif des systèmes moléculaires.