L'étude de systèmes moléculaires s'appuie de plus en plus sur la visualisation informatique des molécules mises en jeu dans le but de faciliter l'analyse et la compréhension de leurs mécanismes d'action. Parallèlement la recherche en informatique graphique et en rendu a connu un essor considérable ces dernières années. Dans ce projet, nous nous appuierons sur les connaissances issues de la recherche en synthèse d'images pour développer de nouveaux algorithmes spécifiquement dédiés à la visualisation de systèmes moléculaires complexes. L'objectif de ces travaux est double. D'une part, nous souhaitons augmenter les performances de rendu, que ce soit en termes de temps de calcul ou de mémoire utilisée. D'autre part, nous proposons de faciliter l'analyse des simulations par les experts en biochimie en développant des techniques automatiques de mises en évidence les propriétés à appréhender. pour cela, nous devrons concevoir de nouveaux algorithmes et structures de données dédiés à ce type de rendu en s'appuyant à la fois sur les configurations géométriques et topologiques des molécules à étudier ainsi que sur leurs caractéristiques biochimiques.